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usdt教程网(www.caibao.it):“脊椎动物基因组设计”宣布系列重磅功效

来源:三亚新闻网 发布时间:2021-05-01 浏览次数:

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  科技日报北京4月28日电 (记者张梦然)脊椎动物基因组研究的“焦点骨架”终出炉——英国《自然》和《自然·通讯》杂志28日揭晓一系列重磅论文,其中一项研究讲述了16个脊椎动物物种迄今最完整、质量最高的基因组。这是国际“脊椎动物基因组设计”(VGP)论文合集中的一篇。这一雄伟设计旨在组装所有已知现存脊椎动物物种的近零差错、高质量基因组。此次的研究功效有助于回覆关于生物学、医学、生物多样性珍爱的基本问题

  参考基因组能让人们洞悉基因组的功效,实现跨物种对照。然则,人们对其认知还存在一些空缺,由于第一代测序和组装手艺成本高、事情量大,速率慢。之后的第二代短读测序手艺虽然成本降低、速率加速,由于使用的测序读取更短,难以准确拼集出基因组,导致组装后的效果更碎片化。

  手艺提高有望攻克这些难题,包罗但不限于长读测序手艺的泛起。《自然》杂志此次揭晓的一篇概述性论文,就评估了用来组装准确性高、近完整参考基因组的多项手艺,并形貌了这些手艺在一群代表脊椎动物各分目的特定物种中的应用。

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  美国国立卫生研究院国家人类基因组研究所、洛克菲勒大学、英国剑桥大学等机构团结团队,此次先用一个物种——朱红蜂鸟(安氏蜂鸟)评估了多项基因组测序和组装手艺。之后,他们又在15个其它物种中应用了其中显示最好的手艺,这15个物种代表了主要的脊椎动物纲,包罗哺乳动物和鸟类(划分以鸭嘴兽和斑胸草雀为代表)、爬行动物、两栖动物和鱼类。优化后的手艺证实了更长的测序读取能从最洪水平上提高基因组质量,组装后的效果还能校正先前参考基因组的重大错误。校正后的基因组显示了之前参考基因组中缺失的基因,甚至是全染色体。

  该研究效果为人们领会基因组演化提供了新的洞见,迄今最周全的遗传密码也为科研职员提供了资源宝库。

  作为大规模国际项目,“脊椎动物基因组设计”共有来自12个国家50个机构的150多名科学家介入,未来还将继续优化相关手艺,其最终目的是为已知现存的71657个脊椎动物物种的每一种绘制出高质量、近零差错率、没有空缺的参考基因组。

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